При хранении в сырых помещениях соты с пергой покрываются плесенью и поражаются клещами. Излишняя же сухость воздуха превращает пергу в сухие комочки, которые не усваиваются пчелами. Сказывается на хранении перги и температура. При температуре, превышающей 8-10° тепла, в сотах могут развиваться личинки восковой моли.
Лучше всего перговые соты упаковывать на зиму в плотные ящики, покрашенные масляной краской, или ульевые корпуса с плотно пригнанными крышками. Оставшиеся щели хорошо при этом заливать воском или заклеивать бумагой. Упакованные таким образом соты с пергой можно хранить в помещении с температурой от 0 до 8-10°С.